Pramuka adalah salah satu ekstrakurikuler wajib dilaksanakan untuk meningkatkan kedisiplinan dan nilai karakter siswa

Pemilihan pengurus OSIS diawali dengan pendaftaran, dan dilanjutkan seleksi oleh pembina OSIS

HSPP atau Hari Studi Pembantu Pelaksana bertujuan untuk meningkatkan potensi dan profesionalisme Pembantu Pelaksana dalam melaksanakan tugasnya di unit kerja masing-masing.

Radio Santos adalah salah satu program OSIS SMP Santo Yosef dalam bidang broadcasting. 

Kegiatan OSIS yang dilakukan setiap Sabtu malam, ajang untuk mengembangkan kreatifitas anak OSIS di bidang penyiaran. Kegiatan dikemas secara seru. Jangan lupa gabung di IG Santosfuture